Військова кафедра Одеського гідрометеорологічного інституту була створена згідно з Постановою Кабінету Міністрів України від 19 серпня 1992 року № 490 “Про реформу системи військової освіти”.

             Наказом ректора Одеського гідрометеорологічного інституту від 22 жовтня 1992 року № 86 у Одеському гідрометеорологічному інституті була відкрита військова кафедра. Військова кафедра Одеського гідрометеорологічного інституту перейменована у кафедру військової підготовки Одеського гідрометеорологічного інституту згідно з Директивою Міністра оборони України від 02 листопада 2000 року № Д 115/1/0425. Кафедра військової підготовки Одеського гідрометеорологічного інституту перейменована у кафедру військової підготовки Одеського державного екологічного університету згідно з Директивою Міністра оборони України від 17 червня 2002 року № Д 115/1/07.

                Першим начальником кафедри було призначено начальника метеорологічної служби 5-ї Повітряної армії полковника КОНКІНА Володимира Васильовича, який на посаді начальника та завідувача очолював її до квітня 2010 р.

              З квітня 2010 р. по цей час кафедру військової підготовки очолює кандидат географічних наук, доцент, полковник ГРУШЕВСЬКИЙ Олег Миколайович. Кафедра військової підготовки є військовим навчальним підрозділом Одеського державного екологічного університету у якості окремого структурного підрозділу.

             З питань організації підготовки військових фахівців та комплектування кадрами згідно з наказом Міністра оборони України від 24 січня 2006 року № 30 “Про управління системою військової освіти Збройних Сил України” кафедра підпорядкована командувачу Повітряних Сил Збройних Сил України.